GWASメタ分析、バイオロジカルネットワーク構築、構造モデリングを用いた腹部大動脈瘤の統合バイオインフォマティクスフレームワーク
カテゴリ：医学教育
公開日：2025年10月24日
タイトル：Integrative bioinformatics frameworks for abdominal aortic aneurysm using GWAS meta-analysis, biological network construction, and structural modeling.
雑誌名：Sci Rep. 2025 Jul 01; 15(1): 22331.
概 要：
腹部大動脈瘤（AAA）は、高い罹患率と死亡率を伴う非感染性疾患であり、世界中で一般的に観察されます。本研究では、AAAに関連する遺伝的変異を特定するために複数の全ゲノム関連解析（GWAS）のメタ分析を実施し、これらの変異が疾患病理に及ぼす機能的影響を探求しました。重要な一塩基多型（SNP）に基づいて差次的に発現する遺伝子（DEG）を特定し、AAA関連のタンパク質間相互作用ネットワークを構築しました。さらに、既存のデータベースを用いて薬剤再利用を行い、分子ドッキングを通じて潜在的な候補を検証しました。新たに42の疾患関連SNPと52の未報告の疾患関連遺伝子を特定しました。
方 法：
本研究は、複数のGWASのメタ分析を用いたコホート研究です。重要なSNPに基づいてDEGを特定し、AAA関連のタンパク質間相互作用ネットワークを構築しました。薬剤再利用のために、薬剤-遺伝子および薬剤-タンパク質相互作用を既存のデータベースから特定し、分子ドッキングを用いて候補を検証しました。
結 果：
新たに42の疾患関連SNPと52の未報告の疾患関連遺伝子を特定しました。74のDEGが特定され、PPIネットワーク分析によりCD40とLRP1が重要なタンパク質として浮かび上がりました。薬剤再利用と分子ドッキングにより、abciximabとpaclitaxelがCD40を標的とする潜在的な治療薬として、ivermectinがLRP1結合の強力な候補として示されました。
結 論：
本研究の統合バイオインフォマティクスフレームワークは、ゲノミクスとトランスクリプトミクスをネットワーク生物学および構造モデリングと結びつけ、AAAの分子メカニズムと潜在的な治療戦略に関する貴重な洞察を提供します。