パンキャンサー転写アイソフォームからの潜在的共有ネオ抗原
カテゴリ：医学教育
公開日：2025年10月24日
タイトル：Potential shared neoantigens from pan-cancer transcript isoforms
雑誌名：Sci Rep. 2025 May 07; 15(1): 15886.
概 要：
本研究は、がんにおけるアイソフォームスイッチングの現象が免疫療法に与える影響を探求しています。がん特異的なアイソフォームから得られるネオ抗原は、広範な患者群に適用可能であり、個別化治療の必要性を減少させる可能性があります。29種類のがんおよび54種類の正常組織タイプにわたる19,500以上のサンプルからなる5つの大規模転写データセットを統合し、複数のがんタイプに共通するがん関連のアイソフォームスイッチングイベントを特定しました。これらの転写物から得られるネオ抗原を含むペプチドの存在が確認され、分子動力学シミュレーションを通じてヒト白血球抗原（HLA）複合体への結合親和性が評価されました。アイソフォームスイッチングが免疫応答を引き起こす有効なネオ抗原の重要な供給源であることが示唆されています。
方 法：
本研究は、29種類のがんおよび54種類の正常組織タイプにわたる19,500以上のサンプルを含む5つの大規模転写データセットを使用した解析を行いました。アイソフォームスイッチングイベントを特定し、ネオ抗原を含むペプチドの存在を確認するために、プロテオームデータセットを利用しました。また、分子動力学シミュレーションを用いて、予測されたネオ抗原のHLA複合体への結合親和性を評価しました。
結 果：
複数のがんタイプに共通するがん関連のアイソフォームスイッチングイベントが特定され、これらの転写物から得られるネオ抗原を含むペプチドが広範ながんおよび正常組織のプロテオームデータセットで確認されました。アイソフォームスイッチングが免疫応答を引き起こすネオ抗原の重要な供給源であることが強く示されました。
結 論：
アイソフォームスイッチングは、さまざまながんタイプにおける広範な免疫療法戦略に活用できる可能性のある有効なネオ抗原の重要な供給源であることが示されました。これにより、個別化治療の必要性を減少させる新たなアプローチが期待されます。