m6A関連lncRNAに基づく予後モデルの開発と検証：乳頭状腎細胞癌患者の予後予測
カテゴリ：手術支援
公開日：2026年2月19日
タイトル：Development and validation of a prognostic model based on m6A-related lncRNAs to predict prognosis for papillary renal cell cancer patients.
雑誌名：Sci Rep. 2024 Dec 28; 14(1): 31460.
概 要：
本研究は、乳頭状腎細胞癌（pRCC）におけるN6-メチルアデノシン（m6A）関連の長鎖非コーディングRNA（lncRNA）が予後および免疫療法の反応を予測する有用性を評価することを目的としています。TCGAデータベースからpRCCサンプルのトランスクリプトームデータを抽出し、Pearson相関分析を用いてm6A関連lncRNAを特定しました。リスクモデルの構築には単変量およびLASSO回帰分析を使用し、生存分析、ROC分析、コンセンサスクラスタリングを通じてその識別能力と予測能力を評価しました。リスク群間の腫瘍変異負荷（TMB）および免疫浸潤を比較し、6つのm6A関連lncRNAを用いた予後ノモグラムを構築し、キャリブレーションおよび意思決定曲線分析（DCA）を通じて検証しました。HCG25およびNOP14-AS1を特異的siRNAを用いてヒトpRCC細胞株でノックダウンし、増殖および移動率をCCK-8およびトランスウェルアッセイで評価しました。
方 法：
本研究は、TCGAデータベースから抽出したpRCCサンプルのトランスクリプトームデータを用いたコホート研究です。153のm6A関連lncRNAを特定し、その中から6つを選定してm6A関連lncRNA pRCC予後モデルを構築しました。リスクモデルの開発には単変量およびLASSO回帰分析を使用し、主要評価指標として生存分析やROC分析を行いました。
結 果：
m6A関連lncRNA pRCC予後モデルは、リスク群間での免疫細胞浸潤に有意な差を示し、SETD2遺伝子の変異が悪い予後と相関していることが確認されました。HCG25およびNOP14-AS1はpRCC細胞の増殖および移動を調節することが示され、モデルの識別能力が検証されました。
結 論：
m6A関連lncRNAに基づく臨床予後ノモグラムを開発し、pRCC患者の予後および免疫環境を予測するために利用できる可能性が示されました。