MEDICINE & AI

タイトル：Exploration of effective biomarkers and infiltrating immune cells in metastatic colorectal cancer based on bioinformatics analysis 雑誌名：Sci Rep. 2025 Sep 26; 15(1): 33156. doi: 10.1038/s41598-025-18589-4. Epub 2025 Sep 26. 概　要： 大腸癌（CRC）は世界で3番目に多い悪性腫瘍であり、癌関連死亡の第2位の原因です。転移性大腸癌（mCRC）は進行した悪性腫瘍として分類され、治療抵抗性や生存率の著しい低下が特徴です。本研究では、CRCのトランスクリプトミクスを解析するための多次元計算フレームワークを実施しました。TCGAおよびGEOリポジトリから遺伝子発現プロファイルを取得し、さまざまなデータ解析を行いました。免疫細胞浸潤分析により、転移性および非転移性大腸癌群間で有意な差異を示す7つの腫瘍浸潤免疫細胞サブタイプが明らかになりました。さらに、28の免疫関連転移性大腸癌差次的発現遺伝子（ICDEGs）が特定され、9つの重要なハブ遺伝子が同定されました。これらの遺伝子は、mCRCにおいてあまり報告されていないものも含まれています。これらのハブ遺伝子は、mCRCの信頼できる診断バイオマーカーとしての可能性を示しています。 方　法： 本研究は、TCGAおよびGEOリポジトリから取得した遺伝子発現プロファイルを用いたバイオインフォマティクス解析に基づいています。データ解析には、ssGSEAアルゴリズム、xCellアルゴリズム、edgeR、limma、DAVID富化解析、CytoHubba、ROCロジスティック回帰、相関分析が含まれています。免疫細胞浸潤分析を通じて、転移性および非転移性大腸癌群間の有意な差異を示す7つの腫瘍浸潤免疫細胞サブタイプを特定しました。 結　果： 転移性大腸癌において、28の免疫関連差次的発現遺伝子（ICDEGs）が同定され、9つの重要なハブ遺伝子（AGTR1、CD86、CMKLR1、FGF1、FYN、IL10RA、INHBA、TNFSF13B、VEGFC）が特定されました。特に、AGTR1、CD86、CMKLR1、TNFSF13BはmCRCにおいてあまり報告されていない遺伝子です。相関研究では、上皮細胞とTNFSF13B、CD86、IL10RAの3つの遺伝子との間に有意な逆相関が示されました。 結　論： 特定された9つのハブ遺伝子は、転移性大腸癌の信頼できる診断バイオマーカーとしての可能性を示し、腫瘍浸潤免疫細胞との相互作用を通じて病因に寄与する可能性があります。これにより、腫瘍微小環境における重要な役割が示唆されます。