サハラ以南アフリカにおける転写体の敗血症エンドタイプの同定：導出、検証、及び二つのウガンダコホートにおけるグローバルな整合性
カテゴリ：公衆衛生・予防医療
公開日：2026年2月19日
タイトル：Identification of transcriptomic sepsis endotypes in sub-Saharan Africa: derivation, validation, and global alignment in two Ugandan cohorts.
雑誌名：Intensive Care Med. 2025 Sep; 51(9): 1573-1586.
概 要：
本研究は、サハラ以南アフリカにおける敗血症の転写体エンドタイプを同定し、その臨床的意義と高所得国で特定されたエンドタイプとの整合性を評価することを目的としています。ウガンダの2つの前向き観察コホート（トロロの田舎コホート243名、エンテベの都市コホート112名）から得られたデータを分析し、無監督クラスタリングを用いてエンドタイプを特定しました。
方 法：
ウガンダの重症敗血症患者を対象にした2つの前向き観察コホートからデータを収集しました。発見コホートでは、全血RNAseqデータの無監督クラスタリングを用いてエンドタイプを同定し、検証コホートではランダムフォレスト分類器を用いてエンドタイプの割り当てを予測しました。差次的遺伝子発現、経路の富化、デジタル細胞計測を用いてエンドタイプの病理生物学を定義し、高所得国由来のエンドタイプとの重複を評価しました。
結 果：
発見コホートで2つのエンドタイプ（ウガンダ敗血症エンドタイプ1（USE-1）と2（USE-2））が同定されました。USE-2は好中球による自然免疫の活性化とリンパ球の抑制が特徴で、より重篤な生理的状態と高い死亡率（41.3%対22.0%、絶対差19.3%、95% CI 7.6-30.9%）と関連していました。検証コホートでは、13遺伝子の分類器（誤分類率1.43%）が同様の生物学的および臨床的プロファイルを持つ2つのエンドタイプを再現しました。USE-2はSRS1および炎症病理エンドタイプとの強い転写的重複を示しましたが、患者レベルの割り当てにはわずかな一致しか見られませんでした。
結 論：
ウガンダにおいて、ターゲット可能な病理生物学の個体差を反映し、高負荷感染における予後の向上をもたらす2つの転写体敗血症エンドタイプを同定しました。高所得国由来のエンドタイプとの乖離は、グローバルに関連しつつ地域に応じた敗血症分類の必要性を強調しています。