骨折治癒における動的ceRNA調節ネットワークの構築
カテゴリ:医療現場の業務効率化
公開日:2026年2月19日
タイトル:Construction of dynamic ceRNA regulatory networks in osteogenesis during fracture healing based on transcriptomic analysis
雑誌名:Sci Rep. 2025 Jul 24; 15(1): 26946.
概 要:
この研究は、骨折治癒に関与する重要な分子と、その競合内因性RNA(ceRNA)調節メカニズムを探求することを目的としています。実験は15匹の成体オスSDラットを用いて行い、骨折後の0、3、7、14、28日目における脛骨のコーラス組織サンプルを収集しました。RNA-Seqによる高スループットトランスクリプトームシーケンシングを実施し、各段階での差次的発現遺伝子(DEGs)、長鎖非コーディングRNA(DELs)、およびマイクロRNA(DEMs)を特定しました。さらに、ceRNAネットワークを構築し、骨折後の骨形成における動的な調節役割を明らかにしました。
方 法:
本研究は、15匹の成体オスSDラットを対象としたコホート研究です。骨折後の0、3、7、14、28日目に脛骨コーラス組織サンプルを収集し、RNA-Seqを用いてトランスクリプトームシーケンシングを行いました。差次的発現解析を通じてDEGs、DELs、DEMsを特定し、STRINGデータベースを用いてタンパク質間相互作用(PPI)ネットワークを構築しました。GOおよびKEGGの富化解析を実施し、miRNA-mRNAおよびlncRNA-miRNA相互作用を予測しました。
結 果:
骨折後の各段階で、3日目に4,997 DEGs、315 DELs、89 DEMs、7日目に5,087 DEGs、300 DELs、84 DEMs、14日目に3,073 DEGs、235 DELs、68 DEMs、28日目に2,609 DEGs、197 DELs、90 DEMsを特定しました。各時間点での中心的な骨形成遺伝子とそのceRNA調節ネットワークを明らかにし、特定のlncRNAとその相互作用するmiRNAおよびmRNAを検証しました。
結 論:
本研究は、骨折後の骨形成に関与するceRNAネットワークを構築し、治癒過程におけるその動的な調節役割と基礎となる分子メカニズムについての洞察を提供しました。